Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRKCSHP14314 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRKCSHP14314 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PRKCSHP14314 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRKCSHP14314 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRKCSHP14314 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRKCSHP14314 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PRKCSHP14314 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRKCSHP14314 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRKCSHP14314 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PRKCSHP14314 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRKCSHP14314 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRKCSHP14314 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKCSHP14314 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRKCSHP14314 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRKCSHP14314 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRKCSHP14314 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRKCSHP14314 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PRKCSHP14314 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PRKCSHP14314 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
PRKCSHP14314 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRKCSHP14314 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKCSHP14314 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRKCSHP14314 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRKCSHP14314 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PRKCSHP14314 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRKCSHP14314 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRKCSHP14314 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRKCSHP14314 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRKCSHP14314 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRKCSHP14314 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRKCSHP14314 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKCSHP14314 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKCSHP14314 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRKCSHP14314 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRKCSHP14314 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKCSHP14314 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRKCSHP14314 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRKCSHP14314 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRKCSHP14314 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRKCSHP14314 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRKCSHP14314 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRKCSHP14314 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRKCSHP14314 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRKCSHP14314 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRKCSHP14314 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRKCSHP14314 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PRKCSHP14314 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRKCSHP14314 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRKCSHP14314 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKCSHP14314 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRKCSHP14314 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKCSHP14314 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRKCSHP14314 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRKCSHP14314 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRKCSHP14314 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRKCSHP14314 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRKCSHP14314 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRKCSHP14314 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRKCSHP14314 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRKCSHP14314 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRKCSHP14314 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRKCSHP14314 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRKCSHP14314 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PRKCSHP14314 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRKCSHP14314 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PRKCSHP14314 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRKCSHP14314 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRKCSHP14314 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRKCSHP14314 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRKCSHP14314 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PRKCSHP14314 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PRKCSHP14314 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PRKCSHP14314 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PRKCSHP14314 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRKCSHP14314 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRKCSHP14314 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRKCSHP14314 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRKCSHP14314 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PRKCSHP14314 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRKCSHP14314 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRKCSHP14314 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRKCSHP14314 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PRKCSHP14314 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PRKCSHP14314 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRKCSHP14314 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRKCSHP14314 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRKCSHP14314 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms