Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRF1P14222 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRF1P14222 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRF1P14222 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRF1P14222 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRF1P14222 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRF1P14222 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRF1P14222 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRF1P14222 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRF1P14222 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRF1P14222 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRF1P14222 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRF1P14222 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRF1P14222 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRF1P14222 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRF1P14222 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRF1P14222 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRF1P14222 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRF1P14222 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRF1P14222 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRF1P14222 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRF1P14222 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRF1P14222 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRF1P14222 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRF1P14222 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRF1P14222 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRF1P14222 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRF1P14222 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRF1P14222 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRF1P14222 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRF1P14222 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRF1P14222 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRF1P14222 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRF1P14222 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRF1P14222 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRF1P14222 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRF1P14222 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRF1P14222 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRF1P14222 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRF1P14222 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRF1P14222 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRF1P14222 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRF1P14222 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRF1P14222 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRF1P14222 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRF1P14222 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRF1P14222 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRF1P14222 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRF1P14222 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRF1P14222 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRF1P14222 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRF1P14222 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRF1P14222 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRF1P14222 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRF1P14222 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRF1P14222 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRF1P14222 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRF1P14222 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRF1P14222 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRF1P14222 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRF1P14222 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRF1P14222 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRF1P14222 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRF1P14222 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRF1P14222 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRF1P14222 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRF1P14222 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRF1P14222 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRF1P14222 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRF1P14222 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRF1P14222 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRF1P14222 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRF1P14222 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRF1P14222 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRF1P14222 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRF1P14222 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRF1P14222 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRF1P14222 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRF1P14222 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRF1P14222 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRF1P14222 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRF1P14222 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRF1P14222 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRF1P14222 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRF1P14222 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRF1P14222 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRF1P14222 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRF1P14222 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRF1P14222 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRF1P14222 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRF1P14222 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRF1P14222 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRF1P14222 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRF1P14222 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRF1P14222 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRF1P14222 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRF1P14222 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRF1P14222 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRF1P14222 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRF1P14222 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms