Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
HSP90AB1P08238 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
HSP90AB1P08238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HSP90AB1P08238 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HSP90AB1P08238 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HSP90AB1P08238 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
HSP90AB1P08238 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
HSP90AB1P08238 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
HSP90AB1P08238 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
HSP90AB1P08238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HSP90AB1P08238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
HSP90AB1P08238 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
HSP90AB1P08238 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HSP90AB1P08238 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
HSP90AB1P08238 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HSP90AB1P08238 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSP90AB1P08238 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
HSP90AB1P08238 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HSP90AB1P08238 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HSP90AB1P08238 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HSP90AB1P08238 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HSP90AB1P08238 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSP90AB1P08238 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HSP90AB1P08238 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HSP90AB1P08238 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HSP90AB1P08238 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HSP90AB1P08238 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HSP90AB1P08238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HSP90AB1P08238 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HSP90AB1P08238 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HSP90AB1P08238 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HSP90AB1P08238 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
HSP90AB1P08238 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
HSP90AB1P08238 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HSP90AB1P08238 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HSP90AB1P08238 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HSP90AB1P08238 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
HSP90AB1P08238 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HSP90AB1P08238 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HSP90AB1P08238 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
HSP90AB1P08238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HSP90AB1P08238 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
HSP90AB1P08238 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HSP90AB1P08238 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HSP90AB1P08238 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HSP90AB1P08238 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HSP90AB1P08238 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HSP90AB1P08238 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HSP90AB1P08238 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
HSP90AB1P08238 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HSP90AB1P08238 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HSP90AB1P08238 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HSP90AB1P08238 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HSP90AB1P08238 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HSP90AB1P08238 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HSP90AB1P08238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HSP90AB1P08238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HSP90AB1P08238 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HSP90AB1P08238 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
HSP90AB1P08238 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HSP90AB1P08238 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HSP90AB1P08238 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms