Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PCNTO95613 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PCNTO95613 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PCNTO95613 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PCNTO95613 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCNTO95613 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PCNTO95613 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PCNTO95613 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PCNTO95613 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PCNTO95613 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PCNTO95613 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PCNTO95613 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PCNTO95613 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PCNTO95613 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PCNTO95613 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PCNTO95613 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PCNTO95613 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PCNTO95613 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
PCNTO95613 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PCNTO95613 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCNTO95613 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCNTO95613 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PCNTO95613 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCNTO95613 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCNTO95613 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCNTO95613 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PCNTO95613 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PCNTO95613 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PCNTO95613 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PCNTO95613 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PCNTO95613 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PCNTO95613 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PCNTO95613 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PCNTO95613 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PCNTO95613 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PCNTO95613 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCNTO95613 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PCNTO95613 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PCNTO95613 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PCNTO95613 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PCNTO95613 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PCNTO95613 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PCNTO95613 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PCNTO95613 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PCNTO95613 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PCNTO95613 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PCNTO95613 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PCNTO95613 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PCNTO95613 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCNTO95613 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PCNTO95613 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCNTO95613 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCNTO95613 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PCNTO95613 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCNTO95613 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PCNTO95613 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PCNTO95613 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PCNTO95613 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PCNTO95613 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PCNTO95613 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PCNTO95613 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCNTO95613 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCNTO95613 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCNTO95613 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCNTO95613 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCNTO95613 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCNTO95613 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCNTO95613 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PCNTO95613 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCNTO95613 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PCNTO95613 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PCNTO95613 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PCNTO95613 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PCNTO95613 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCNTO95613 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PCNTO95613 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCNTO95613 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCNTO95613 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PCNTO95613 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PCNTO95613 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCNTO95613 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCNTO95613 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCNTO95613 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCNTO95613 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PCNTO95613 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCNTO95613 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCNTO95613 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCNTO95613 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCNTO95613 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCNTO95613 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCNTO95613 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PCNTO95613 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCNTO95613 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCNTO95613 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCNTO95613 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCNTO95613 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PCNTO95613 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PCNTO95613 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PCNTO95613 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCNTO95613 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms