Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PCNTO95613 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCNTO95613 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCNTO95613 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PCNTO95613 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PCNTO95613 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCNTO95613 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PCNTO95613 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCNTO95613 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCNTO95613 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCNTO95613 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCNTO95613 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCNTO95613 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCNTO95613 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCNTO95613 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCNTO95613 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCNTO95613 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PCNTO95613 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCNTO95613 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCNTO95613 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PCNTO95613 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PCNTO95613 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCNTO95613 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCNTO95613 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCNTO95613 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCNTO95613 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCNTO95613 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCNTO95613 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCNTO95613 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCNTO95613 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCNTO95613 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCNTO95613 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PCNTO95613 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCNTO95613 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PCNTO95613 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCNTO95613 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCNTO95613 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PCNTO95613 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PCNTO95613 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PCNTO95613 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PCNTO95613 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCNTO95613 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCNTO95613 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCNTO95613 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PCNTO95613 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCNTO95613 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCNTO95613 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCNTO95613 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCNTO95613 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCNTO95613 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PCNTO95613 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCNTO95613 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCNTO95613 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PCNTO95613 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PCNTO95613 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PCNTO95613 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCNTO95613 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCNTO95613 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCNTO95613 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCNTO95613 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCNTO95613 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCNTO95613 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCNTO95613 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PCNTO95613 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCNTO95613 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCNTO95613 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCNTO95613 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PCNTO95613 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCNTO95613 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCNTO95613 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCNTO95613 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCNTO95613 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCNTO95613 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PCNTO95613 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCNTO95613 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PCNTO95613 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PCNTO95613 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCNTO95613 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCNTO95613 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PCNTO95613 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCNTO95613 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCNTO95613 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCNTO95613 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCNTO95613 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCNTO95613 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCNTO95613 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCNTO95613 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCNTO95613 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCNTO95613 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCNTO95613 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCNTO95613 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCNTO95613 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCNTO95613 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCNTO95613 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCNTO95613 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PCNTO95613 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PCNTO95613 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PCNTO95613 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCNTO95613 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCNTO95613 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms