Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ABCC6O95255 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
ABCC6O95255 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC6O95255 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC6O95255 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC6O95255 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC6O95255 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCC6O95255 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
ABCC6O95255 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCC6O95255 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ABCC6O95255 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC6O95255 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC6O95255 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ABCC6O95255 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
ABCC6O95255 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC6O95255 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ABCC6O95255 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCC6O95255 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ABCC6O95255 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCC6O95255 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCC6O95255 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC6O95255 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC6O95255 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC6O95255 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC6O95255 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC6O95255 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ABCC6O95255 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ABCC6O95255 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC6O95255 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC6O95255 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC6O95255 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ABCC6O95255 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ABCC6O95255 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC6O95255 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC6O95255 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42■■■■■ 4.31
ABCC6O95255 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC6O95255 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC6O95255 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC6O95255 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC6O95255 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ABCC6O95255 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC6O95255 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCC6O95255 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCC6O95255 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ABCC6O95255 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ABCC6O95255 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC6O95255 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC6O95255 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ABCC6O95255 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ABCC6O95255 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ABCC6O95255 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ABCC6O95255 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC6O95255 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC6O95255 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ABCC6O95255 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC6O95255 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC6O95255 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC6O95255 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC6O95255 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC6O95255 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC6O95255 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC6O95255 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC6O95255 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC6O95255 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ABCC6O95255 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC6O95255 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC6O95255 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC6O95255 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ABCC6O95255 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ABCC6O95255 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ABCC6O95255 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ABCC6O95255 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ABCC6O95255 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC6O95255 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC6O95255 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC6O95255 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC6O95255 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC6O95255 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC6O95255 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC6O95255 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ABCC6O95255 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ABCC6O95255 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ABCC6O95255 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
ABCC6O95255 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ABCC6O95255 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ABCC6O95255 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ABCC6O95255 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ABCC6O95255 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ABCC6O95255 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ABCC6O95255 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ABCC6O95255 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ABCC6O95255 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ABCC6O95255 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
ABCC6O95255 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ABCC6O95255 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ABCC6O95255 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
ABCC6O95255 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ABCC6O95255 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ABCC6O95255 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ABCC6O95255 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms