Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.46■■■■■ 4.71
RPS6KA4O75676 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RPS6KA4O75676 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
RPS6KA4O75676 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RPS6KA4O75676 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RPS6KA4O75676 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RPS6KA4O75676 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
RPS6KA4O75676 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
RPS6KA4O75676 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RPS6KA4O75676 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
RPS6KA4O75676 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RPS6KA4O75676 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RPS6KA4O75676 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RPS6KA4O75676 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RPS6KA4O75676 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RPS6KA4O75676 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RPS6KA4O75676 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
RPS6KA4O75676 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
RPS6KA4O75676 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
RPS6KA4O75676 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RPS6KA4O75676 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RPS6KA4O75676 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
RPS6KA4O75676 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RPS6KA4O75676 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RPS6KA4O75676 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
RPS6KA4O75676 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RPS6KA4O75676 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RPS6KA4O75676 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
RPS6KA4O75676 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RPS6KA4O75676 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RPS6KA4O75676 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RPS6KA4O75676 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RPS6KA4O75676 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
RPS6KA4O75676 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
RPS6KA4O75676 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RPS6KA4O75676 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
RPS6KA4O75676 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RPS6KA4O75676 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RPS6KA4O75676 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RPS6KA4O75676 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RPS6KA4O75676 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
RPS6KA4O75676 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RPS6KA4O75676 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RPS6KA4O75676 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RPS6KA4O75676 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RPS6KA4O75676 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
RPS6KA4O75676 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RPS6KA4O75676 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RPS6KA4O75676 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RPS6KA4O75676 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RPS6KA4O75676 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RPS6KA4O75676 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
RPS6KA4O75676 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RPS6KA4O75676 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RPS6KA4O75676 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
RPS6KA4O75676 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
RPS6KA4O75676 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RPS6KA4O75676 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RPS6KA4O75676 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RPS6KA4O75676 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPS6KA4O75676 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RPS6KA4O75676 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RPS6KA4O75676 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RPS6KA4O75676 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RPS6KA4O75676 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RPS6KA4O75676 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RPS6KA4O75676 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RPS6KA4O75676 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RPS6KA4O75676 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RPS6KA4O75676 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RPS6KA4O75676 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RPS6KA4O75676 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RPS6KA4O75676 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RPS6KA4O75676 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RPS6KA4O75676 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPS6KA4O75676 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RPS6KA4O75676 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RPS6KA4O75676 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RPS6KA4O75676 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RPS6KA4O75676 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RPS6KA4O75676 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RPS6KA4O75676 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
RPS6KA4O75676 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPS6KA4O75676 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPS6KA4O75676 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RPS6KA4O75676 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RPS6KA4O75676 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RPS6KA4O75676 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RPS6KA4O75676 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPS6KA4O75676 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPS6KA4O75676 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RPS6KA4O75676 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RPS6KA4O75676 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RPS6KA4O75676 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms