Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PPFIA3O75145 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PPFIA3O75145 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
PPFIA3O75145 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PPFIA3O75145 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PPFIA3O75145 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPFIA3O75145 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PPFIA3O75145 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PPFIA3O75145 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPFIA3O75145 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPFIA3O75145 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPFIA3O75145 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PPFIA3O75145 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PPFIA3O75145 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPFIA3O75145 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PPFIA3O75145 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPFIA3O75145 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PPFIA3O75145 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPFIA3O75145 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PPFIA3O75145 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PPFIA3O75145 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPFIA3O75145 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPFIA3O75145 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PPFIA3O75145 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPFIA3O75145 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PPFIA3O75145 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPFIA3O75145 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPFIA3O75145 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PPFIA3O75145 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPFIA3O75145 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPFIA3O75145 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPFIA3O75145 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPFIA3O75145 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPFIA3O75145 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPFIA3O75145 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PPFIA3O75145 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPFIA3O75145 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPFIA3O75145 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPFIA3O75145 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PPFIA3O75145 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PPFIA3O75145 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PPFIA3O75145 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPFIA3O75145 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPFIA3O75145 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPFIA3O75145 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPFIA3O75145 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPFIA3O75145 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PPFIA3O75145 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPFIA3O75145 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPFIA3O75145 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPFIA3O75145 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPFIA3O75145 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PPFIA3O75145 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PPFIA3O75145 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PPFIA3O75145 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PPFIA3O75145 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PPFIA3O75145 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PPFIA3O75145 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PPFIA3O75145 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PPFIA3O75145 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPFIA3O75145 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPFIA3O75145 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PPFIA3O75145 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPFIA3O75145 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPFIA3O75145 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPFIA3O75145 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PPFIA3O75145 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PPFIA3O75145 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PPFIA3O75145 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPFIA3O75145 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPFIA3O75145 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPFIA3O75145 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPFIA3O75145 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PPFIA3O75145 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPFIA3O75145 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PPFIA3O75145 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PPFIA3O75145 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PPFIA3O75145 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPFIA3O75145 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPFIA3O75145 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPFIA3O75145 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPFIA3O75145 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPFIA3O75145 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPFIA3O75145 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPFIA3O75145 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPFIA3O75145 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPFIA3O75145 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPFIA3O75145 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPFIA3O75145 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPFIA3O75145 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPFIA3O75145 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPFIA3O75145 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPFIA3O75145 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPFIA3O75145 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PPFIA3O75145 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PPFIA3O75145 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPFIA3O75145 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPFIA3O75145 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPFIA3O75145 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPFIA3O75145 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms