Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BUD23O43709 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BUD23O43709 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
BUD23O43709 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BUD23O43709 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BUD23O43709 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BUD23O43709 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BUD23O43709 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BUD23O43709 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BUD23O43709 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BUD23O43709 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BUD23O43709 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BUD23O43709 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
BUD23O43709 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BUD23O43709 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BUD23O43709 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
BUD23O43709 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BUD23O43709 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BUD23O43709 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BUD23O43709 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BUD23O43709 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BUD23O43709 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BUD23O43709 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BUD23O43709 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BUD23O43709 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BUD23O43709 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BUD23O43709 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BUD23O43709 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BUD23O43709 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BUD23O43709 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BUD23O43709 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BUD23O43709 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BUD23O43709 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BUD23O43709 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BUD23O43709 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BUD23O43709 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BUD23O43709 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BUD23O43709 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BUD23O43709 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BUD23O43709 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BUD23O43709 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BUD23O43709 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BUD23O43709 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BUD23O43709 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BUD23O43709 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BUD23O43709 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BUD23O43709 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BUD23O43709 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BUD23O43709 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BUD23O43709 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BUD23O43709 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BUD23O43709 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BUD23O43709 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BUD23O43709 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BUD23O43709 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BUD23O43709 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BUD23O43709 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BUD23O43709 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BUD23O43709 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BUD23O43709 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BUD23O43709 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BUD23O43709 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BUD23O43709 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BUD23O43709 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BUD23O43709 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BUD23O43709 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BUD23O43709 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BUD23O43709 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BUD23O43709 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BUD23O43709 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BUD23O43709 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BUD23O43709 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BUD23O43709 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BUD23O43709 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BUD23O43709 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BUD23O43709 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BUD23O43709 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BUD23O43709 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BUD23O43709 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BUD23O43709 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BUD23O43709 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BUD23O43709 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BUD23O43709 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BUD23O43709 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BUD23O43709 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BUD23O43709 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BUD23O43709 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BUD23O43709 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BUD23O43709 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BUD23O43709 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BUD23O43709 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BUD23O43709 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BUD23O43709 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BUD23O43709 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BUD23O43709 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BUD23O43709 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BUD23O43709 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BUD23O43709 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BUD23O43709 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BUD23O43709 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms