Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BUD23O43709 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BUD23O43709 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BUD23O43709 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BUD23O43709 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BUD23O43709 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BUD23O43709 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BUD23O43709 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BUD23O43709 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BUD23O43709 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BUD23O43709 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BUD23O43709 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BUD23O43709 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BUD23O43709 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BUD23O43709 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BUD23O43709 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BUD23O43709 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BUD23O43709 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BUD23O43709 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BUD23O43709 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BUD23O43709 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BUD23O43709 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BUD23O43709 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BUD23O43709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BUD23O43709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BUD23O43709 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BUD23O43709 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BUD23O43709 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BUD23O43709 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUD23O43709 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUD23O43709 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BUD23O43709 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BUD23O43709 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BUD23O43709 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BUD23O43709 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BUD23O43709 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BUD23O43709 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUD23O43709 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUD23O43709 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BUD23O43709 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUD23O43709 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BUD23O43709 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BUD23O43709 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUD23O43709 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BUD23O43709 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUD23O43709 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BUD23O43709 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BUD23O43709 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BUD23O43709 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUD23O43709 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUD23O43709 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUD23O43709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUD23O43709 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BUD23O43709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUD23O43709 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BUD23O43709 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUD23O43709 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BUD23O43709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BUD23O43709 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUD23O43709 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUD23O43709 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUD23O43709 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BUD23O43709 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BUD23O43709 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BUD23O43709 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BUD23O43709 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUD23O43709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BUD23O43709 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BUD23O43709 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BUD23O43709 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BUD23O43709 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BUD23O43709 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BUD23O43709 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BUD23O43709 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BUD23O43709 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BUD23O43709 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BUD23O43709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BUD23O43709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms