Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNA1GO43497 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNA1GO43497 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CACNA1GO43497 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CACNA1GO43497 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNA1GO43497 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNA1GO43497 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1GO43497 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CACNA1GO43497 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CACNA1GO43497 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA1GO43497 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CACNA1GO43497 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNA1GO43497 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNA1GO43497 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1GO43497 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA1GO43497 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1GO43497 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1GO43497 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1GO43497 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1GO43497 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1GO43497 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1GO43497 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CACNA1GO43497 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNA1GO43497 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNA1GO43497 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNA1GO43497 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1GO43497 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNA1GO43497 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1GO43497 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1GO43497 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1GO43497 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1GO43497 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNA1GO43497 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNA1GO43497 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA1GO43497 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1GO43497 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA1GO43497 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA1GO43497 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CACNA1GO43497 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA1GO43497 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNA1GO43497 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA1GO43497 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA1GO43497 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA1GO43497 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA1GO43497 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CACNA1GO43497 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA1GO43497 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CACNA1GO43497 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CACNA1GO43497 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1GO43497 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CACNA1GO43497 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CACNA1GO43497 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNA1GO43497 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNA1GO43497 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CACNA1GO43497 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNA1GO43497 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1GO43497 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1GO43497 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1GO43497 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA1GO43497 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNA1GO43497 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNA1GO43497 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNA1GO43497 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA1GO43497 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNA1GO43497 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNA1GO43497 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA1GO43497 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CACNA1GO43497 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA1GO43497 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1GO43497 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA1GO43497 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA1GO43497 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA1GO43497 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1GO43497 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1GO43497 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1GO43497 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1GO43497 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1GO43497 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA1GO43497 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA1GO43497 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA1GO43497 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA1GO43497 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1GO43497 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA1GO43497 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1GO43497 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1GO43497 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1GO43497 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNA1GO43497 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1GO43497 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1GO43497 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1GO43497 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1GO43497 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1GO43497 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1GO43497 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1GO43497 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1GO43497 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1GO43497 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1GO43497 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1GO43497 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1GO43497 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms