Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SEPT4O43236 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SEPT4O43236 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SEPT4O43236 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SEPT4O43236 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SEPT4O43236 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
SEPT4O43236 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SEPT4O43236 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SEPT4O43236 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SEPT4O43236 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SEPT4O43236 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SEPT4O43236 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SEPT4O43236 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SEPT4O43236 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SEPT4O43236 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SEPT4O43236 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SEPT4O43236 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SEPT4O43236 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SEPT4O43236 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SEPT4O43236 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SEPT4O43236 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SEPT4O43236 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SEPT4O43236 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SEPT4O43236 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SEPT4O43236 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SEPT4O43236 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SEPT4O43236 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SEPT4O43236 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SEPT4O43236 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SEPT4O43236 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SEPT4O43236 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SEPT4O43236 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SEPT4O43236 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SEPT4O43236 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SEPT4O43236 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SEPT4O43236 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SEPT4O43236 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SEPT4O43236 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SEPT4O43236 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SEPT4O43236 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SEPT4O43236 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SEPT4O43236 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SEPT4O43236 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SEPT4O43236 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SEPT4O43236 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SEPT4O43236 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SEPT4O43236 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SEPT4O43236 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SEPT4O43236 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SEPT4O43236 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SEPT4O43236 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SEPT4O43236 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SEPT4O43236 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SEPT4O43236 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SEPT4O43236 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEPT4O43236 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEPT4O43236 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEPT4O43236 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SEPT4O43236 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SEPT4O43236 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEPT4O43236 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SEPT4O43236 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SEPT4O43236 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SEPT4O43236 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SEPT4O43236 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEPT4O43236 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SEPT4O43236 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SEPT4O43236 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SEPT4O43236 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SEPT4O43236 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SEPT4O43236 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SEPT4O43236 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SEPT4O43236 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SEPT4O43236 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SEPT4O43236 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SEPT4O43236 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SEPT4O43236 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SEPT4O43236 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SEPT4O43236 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEPT4O43236 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SEPT4O43236 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEPT4O43236 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEPT4O43236 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SEPT4O43236 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SEPT4O43236 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEPT4O43236 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEPT4O43236 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEPT4O43236 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEPT4O43236 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms