Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMA5O15230 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMA5O15230 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMA5O15230 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LAMA5O15230 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA5O15230 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LAMA5O15230 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMA5O15230 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMA5O15230 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
LAMA5O15230 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LAMA5O15230 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LAMA5O15230 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LAMA5O15230 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA5O15230 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMA5O15230 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA5O15230 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMA5O15230 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMA5O15230 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMA5O15230 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMA5O15230 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA5O15230 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA5O15230 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMA5O15230 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA5O15230 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA5O15230 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA5O15230 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA5O15230 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA5O15230 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA5O15230 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMA5O15230 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LAMA5O15230 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMA5O15230 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAMA5O15230 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA5O15230 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA5O15230 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA5O15230 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA5O15230 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA5O15230 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA5O15230 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA5O15230 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA5O15230 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA5O15230 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA5O15230 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA5O15230 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA5O15230 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA5O15230 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMA5O15230 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA5O15230 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA5O15230 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA5O15230 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA5O15230 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA5O15230 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA5O15230 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMA5O15230 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA5O15230 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA5O15230 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMA5O15230 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMA5O15230 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA5O15230 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA5O15230 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA5O15230 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA5O15230 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA5O15230 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA5O15230 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMA5O15230 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA5O15230 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMA5O15230 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMA5O15230 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMA5O15230 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMA5O15230 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA5O15230 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA5O15230 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA5O15230 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA5O15230 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA5O15230 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA5O15230 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA5O15230 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA5O15230 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA5O15230 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.4 ms