Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.91■■■■■ 5.9
KIF3BO15066 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.44■■■■■ 5.83
KIF3BO15066 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.74■■■■■ 5.71
KIF3BO15066 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
KIF3BO15066 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
KIF3BO15066 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
KIF3BO15066 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
KIF3BO15066 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
KIF3BO15066 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
KIF3BO15066 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.03■■■■■ 5.44
KIF3BO15066 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
KIF3BO15066 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.84■■■■■ 5.41
KIF3BO15066 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.81■■■■■ 5.4
KIF3BO15066 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
KIF3BO15066 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
KIF3BO15066 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
KIF3BO15066 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
KIF3BO15066 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
KIF3BO15066 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
KIF3BO15066 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
KIF3BO15066 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
KIF3BO15066 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
KIF3BO15066 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
KIF3BO15066 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.55■■■■■ 5.2
KIF3BO15066 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
KIF3BO15066 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
KIF3BO15066 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
KIF3BO15066 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
KIF3BO15066 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
KIF3BO15066 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
KIF3BO15066 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
KIF3BO15066 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
KIF3BO15066 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
KIF3BO15066 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
KIF3BO15066 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
KIF3BO15066 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
KIF3BO15066 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
KIF3BO15066 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
KIF3BO15066 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
KIF3BO15066 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
KIF3BO15066 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
KIF3BO15066 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
KIF3BO15066 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
KIF3BO15066 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
KIF3BO15066 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
KIF3BO15066 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
KIF3BO15066 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
KIF3BO15066 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
KIF3BO15066 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
KIF3BO15066 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
KIF3BO15066 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
KIF3BO15066 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
KIF3BO15066 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
KIF3BO15066 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
KIF3BO15066 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
KIF3BO15066 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
KIF3BO15066 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
KIF3BO15066 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
KIF3BO15066 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
KIF3BO15066 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
KIF3BO15066 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
KIF3BO15066 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
KIF3BO15066 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
KIF3BO15066 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
KIF3BO15066 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
KIF3BO15066 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
KIF3BO15066 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
KIF3BO15066 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
KIF3BO15066 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
KIF3BO15066 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
KIF3BO15066 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
KIF3BO15066 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
KIF3BO15066 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
KIF3BO15066 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
KIF3BO15066 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
KIF3BO15066 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
KIF3BO15066 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
KIF3BO15066 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.58■■■■■ 4.73
KIF3BO15066 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
KIF3BO15066 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.46■■■■■ 4.71
KIF3BO15066 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
KIF3BO15066 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
KIF3BO15066 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
KIF3BO15066 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
KIF3BO15066 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
KIF3BO15066 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
KIF3BO15066 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
KIF3BO15066 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
KIF3BO15066 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
KIF3BO15066 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
KIF3BO15066 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
KIF3BO15066 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
KIF3BO15066 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
KIF3BO15066 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
KIF3BO15066 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms