Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF561-AS1K7EIQ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF561-AS1K7EIQ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF561-AS1K7EIQ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF561-AS1K7EIQ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF561-AS1K7EIQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF561-AS1K7EIQ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF561-AS1K7EIQ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF561-AS1K7EIQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF561-AS1K7EIQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF561-AS1K7EIQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF561-AS1K7EIQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF561-AS1K7EIQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF561-AS1K7EIQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF561-AS1K7EIQ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF561-AS1K7EIQ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF561-AS1K7EIQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF561-AS1K7EIQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF561-AS1K7EIQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF561-AS1K7EIQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF561-AS1K7EIQ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF561-AS1K7EIQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF561-AS1K7EIQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF561-AS1K7EIQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF561-AS1K7EIQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF561-AS1K7EIQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF561-AS1K7EIQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF561-AS1K7EIQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF561-AS1K7EIQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF561-AS1K7EIQ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF561-AS1K7EIQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF561-AS1K7EIQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF561-AS1K7EIQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF561-AS1K7EIQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms