Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBY3A6NI87 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBY3A6NI87 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBY3A6NI87 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBY3A6NI87 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBY3A6NI87 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBY3A6NI87 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBY3A6NI87 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBY3A6NI87 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBY3A6NI87 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBY3A6NI87 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBY3A6NI87 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBY3A6NI87 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBY3A6NI87 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBY3A6NI87 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBY3A6NI87 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBY3A6NI87 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBY3A6NI87 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBY3A6NI87 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBY3A6NI87 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBY3A6NI87 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBY3A6NI87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBY3A6NI87 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBY3A6NI87 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBY3A6NI87 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBY3A6NI87 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBY3A6NI87 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBY3A6NI87 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBY3A6NI87 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBY3A6NI87 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBY3A6NI87 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBY3A6NI87 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBY3A6NI87 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBY3A6NI87 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBY3A6NI87 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBY3A6NI87 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBY3A6NI87 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBY3A6NI87 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBY3A6NI87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBY3A6NI87 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBY3A6NI87 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBY3A6NI87 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBY3A6NI87 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBY3A6NI87 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBY3A6NI87 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBY3A6NI87 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBY3A6NI87 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBY3A6NI87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBY3A6NI87 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBY3A6NI87 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBY3A6NI87 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBY3A6NI87 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBY3A6NI87 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBY3A6NI87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBY3A6NI87 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBY3A6NI87 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBY3A6NI87 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBY3A6NI87 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBY3A6NI87 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBY3A6NI87 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBY3A6NI87 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBY3A6NI87 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBY3A6NI87 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBY3A6NI87 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBY3A6NI87 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBY3A6NI87 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBY3A6NI87 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBY3A6NI87 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBY3A6NI87 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms