Protein–RNA interactions for Protein: A5LHX3

PSMB11, Proteasome subunit beta type-11, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB11A5LHX3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMB11A5LHX3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB11A5LHX3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSMB11A5LHX3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMB11A5LHX3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB11A5LHX3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB11A5LHX3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB11A5LHX3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMB11A5LHX3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMB11A5LHX3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB11A5LHX3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB11A5LHX3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB11A5LHX3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB11A5LHX3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB11A5LHX3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB11A5LHX3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMB11A5LHX3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMB11A5LHX3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB11A5LHX3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB11A5LHX3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB11A5LHX3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB11A5LHX3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB11A5LHX3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB11A5LHX3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB11A5LHX3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB11A5LHX3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB11A5LHX3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB11A5LHX3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB11A5LHX3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMB11A5LHX3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB11A5LHX3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB11A5LHX3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB11A5LHX3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB11A5LHX3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB11A5LHX3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB11A5LHX3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB11A5LHX3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB11A5LHX3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB11A5LHX3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB11A5LHX3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB11A5LHX3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB11A5LHX3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB11A5LHX3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB11A5LHX3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB11A5LHX3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB11A5LHX3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB11A5LHX3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB11A5LHX3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB11A5LHX3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB11A5LHX3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB11A5LHX3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB11A5LHX3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB11A5LHX3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB11A5LHX3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB11A5LHX3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB11A5LHX3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB11A5LHX3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB11A5LHX3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB11A5LHX3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB11A5LHX3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB11A5LHX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB11A5LHX3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB11A5LHX3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB11A5LHX3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB11A5LHX3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB11A5LHX3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB11A5LHX3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB11A5LHX3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB11A5LHX3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB11A5LHX3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB11A5LHX3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB11A5LHX3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB11A5LHX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB11A5LHX3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB11A5LHX3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB11A5LHX3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB11A5LHX3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB11A5LHX3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB11A5LHX3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB11A5LHX3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB11A5LHX3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB11A5LHX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB11A5LHX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB11A5LHX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms