Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
LAMB4A4D0S4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
LAMB4A4D0S4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
LAMB4A4D0S4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
LAMB4A4D0S4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
LAMB4A4D0S4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
LAMB4A4D0S4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
LAMB4A4D0S4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.76■■■■■ 4.43
LAMB4A4D0S4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
LAMB4A4D0S4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
LAMB4A4D0S4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
LAMB4A4D0S4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
LAMB4A4D0S4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
LAMB4A4D0S4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
LAMB4A4D0S4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LAMB4A4D0S4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
LAMB4A4D0S4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LAMB4A4D0S4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
LAMB4A4D0S4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
LAMB4A4D0S4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
LAMB4A4D0S4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
LAMB4A4D0S4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
LAMB4A4D0S4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
LAMB4A4D0S4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LAMB4A4D0S4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LAMB4A4D0S4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
LAMB4A4D0S4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LAMB4A4D0S4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LAMB4A4D0S4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
LAMB4A4D0S4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
LAMB4A4D0S4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
LAMB4A4D0S4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
LAMB4A4D0S4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
LAMB4A4D0S4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
LAMB4A4D0S4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
LAMB4A4D0S4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
LAMB4A4D0S4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
LAMB4A4D0S4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
LAMB4A4D0S4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
LAMB4A4D0S4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
LAMB4A4D0S4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
LAMB4A4D0S4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
LAMB4A4D0S4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
LAMB4A4D0S4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
LAMB4A4D0S4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
LAMB4A4D0S4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
LAMB4A4D0S4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LAMB4A4D0S4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
LAMB4A4D0S4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
LAMB4A4D0S4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
LAMB4A4D0S4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
LAMB4A4D0S4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
LAMB4A4D0S4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
LAMB4A4D0S4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
LAMB4A4D0S4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LAMB4A4D0S4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
LAMB4A4D0S4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
LAMB4A4D0S4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
LAMB4A4D0S4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
LAMB4A4D0S4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
LAMB4A4D0S4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LAMB4A4D0S4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LAMB4A4D0S4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMB4A4D0S4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMB4A4D0S4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMB4A4D0S4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMB4A4D0S4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMB4A4D0S4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
LAMB4A4D0S4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
LAMB4A4D0S4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LAMB4A4D0S4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMB4A4D0S4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LAMB4A4D0S4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
LAMB4A4D0S4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LAMB4A4D0S4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LAMB4A4D0S4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LAMB4A4D0S4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LAMB4A4D0S4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LAMB4A4D0S4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMB4A4D0S4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LAMB4A4D0S4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMB4A4D0S4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMB4A4D0S4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LAMB4A4D0S4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMB4A4D0S4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMB4A4D0S4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LAMB4A4D0S4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LAMB4A4D0S4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
LAMB4A4D0S4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LAMB4A4D0S4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LAMB4A4D0S4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LAMB4A4D0S4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LAMB4A4D0S4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMB4A4D0S4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms