Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQY0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQY0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
A0A1W2PQY0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
A0A1W2PQY0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
A0A1W2PQY0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
A0A1W2PQY0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
A0A1W2PQY0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
A0A1W2PQY0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
A0A1W2PQY0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
A0A1W2PQY0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
A0A1W2PQY0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
A0A1W2PQY0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
A0A1W2PQY0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
A0A1W2PQY0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
A0A1W2PQY0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
A0A1W2PQY0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
A0A1W2PQY0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
A0A1W2PQY0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
A0A1W2PQY0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
A0A1W2PQY0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
A0A1W2PQY0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
A0A1W2PQY0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
A0A1W2PQY0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
A0A1W2PQY0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
A0A1W2PQY0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
A0A1W2PQY0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
A0A1W2PQY0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
A0A1W2PQY0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
A0A1W2PQY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
A0A1W2PQY0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
A0A1W2PQY0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
A0A1W2PQY0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
A0A1W2PQY0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
A0A1W2PQY0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
A0A1W2PQY0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
A0A1W2PQY0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
A0A1W2PQY0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
A0A1W2PQY0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
A0A1W2PQY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
A0A1W2PQY0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
A0A1W2PQY0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
A0A1W2PQY0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
A0A1W2PQY0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
A0A1W2PQY0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
A0A1W2PQY0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
A0A1W2PQY0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
A0A1W2PQY0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
A0A1W2PQY0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
A0A1W2PQY0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
A0A1W2PQY0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
A0A1W2PQY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
A0A1W2PQY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
A0A1W2PQY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
A0A1W2PQY0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
A0A1W2PQY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
A0A1W2PQY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
A0A1W2PQY0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
A0A1W2PQY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
A0A1W2PQY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
A0A1W2PQY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
A0A1W2PQY0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
A0A1W2PQY0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
A0A1W2PQY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
A0A1W2PQY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
A0A1W2PQY0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
A0A1W2PQY0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
A0A1W2PQY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
A0A1W2PQY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
A0A1W2PQY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
A0A1W2PQY0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
A0A1W2PQY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
A0A1W2PQY0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
A0A1W2PQY0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
A0A1W2PQY0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
A0A1W2PQY0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
A0A1W2PQY0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
A0A1W2PQY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
A0A1W2PQY0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A0A1W2PQY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
A0A1W2PQY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
A0A1W2PQY0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
A0A1W2PQY0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
A0A1W2PQY0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
A0A1W2PQY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
A0A1W2PQY0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms