Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAV26-1A0A087WT03 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAV26-1A0A087WT03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV26-1A0A087WT03 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV26-1A0A087WT03 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV26-1A0A087WT03 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV26-1A0A087WT03 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV26-1A0A087WT03 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV26-1A0A087WT03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV26-1A0A087WT03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV26-1A0A087WT03 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV26-1A0A087WT03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV26-1A0A087WT03 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV26-1A0A087WT03 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV26-1A0A087WT03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV26-1A0A087WT03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV26-1A0A087WT03 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAV26-1A0A087WT03 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV26-1A0A087WT03 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV26-1A0A087WT03 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV26-1A0A087WT03 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV26-1A0A087WT03 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV26-1A0A087WT03 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV26-1A0A087WT03 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV26-1A0A087WT03 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV26-1A0A087WT03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV26-1A0A087WT03 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV26-1A0A087WT03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAV26-1A0A087WT03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAV26-1A0A087WT03 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAV26-1A0A087WT03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV26-1A0A087WT03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV26-1A0A087WT03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV26-1A0A087WT03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV26-1A0A087WT03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV26-1A0A087WT03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV26-1A0A087WT03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV26-1A0A087WT03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV26-1A0A087WT03 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV26-1A0A087WT03 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV26-1A0A087WT03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV26-1A0A087WT03 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV26-1A0A087WT03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV26-1A0A087WT03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV26-1A0A087WT03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV26-1A0A087WT03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV26-1A0A087WT03 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV26-1A0A087WT03 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV26-1A0A087WT03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV26-1A0A087WT03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV26-1A0A087WT03 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV26-1A0A087WT03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAV26-1A0A087WT03 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAV26-1A0A087WT03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV26-1A0A087WT03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAV26-1A0A087WT03 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAV26-1A0A087WT03 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAV26-1A0A087WT03 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAV26-1A0A087WT03 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAV26-1A0A087WT03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAV26-1A0A087WT03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAV26-1A0A087WT03 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAV26-1A0A087WT03 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAV26-1A0A087WT03 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAV26-1A0A087WT03 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAV26-1A0A087WT03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAV26-1A0A087WT03 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAV26-1A0A087WT03 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAV26-1A0A087WT03 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAV26-1A0A087WT03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAV26-1A0A087WT03 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAV26-1A0A087WT03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAV26-1A0A087WT03 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAV26-1A0A087WT03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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