Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARFGEF2Q9Y6D5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARFGEF2Q9Y6D5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARFGEF2Q9Y6D5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms