Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP13Q9UII6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP13Q9UII6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP13Q9UII6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP13Q9UII6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms