Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCHIP1Q9P0W5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCHIP1Q9P0W5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCHIP1Q9P0W5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms