Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VNN3Q9NY84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VNN3Q9NY84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VNN3Q9NY84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms