Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FBXO28Q9NVF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FBXO28Q9NVF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FBXO28Q9NVF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FBXO28Q9NVF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO28Q9NVF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO28Q9NVF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO28Q9NVF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO28Q9NVF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO28Q9NVF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO28Q9NVF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms