Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM106BQ9NUM4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM106BQ9NUM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms