Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITM2CQ9NQX7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2CQ9NQX7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2CQ9NQX7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITM2CQ9NQX7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2CQ9NQX7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms