Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4A4

RNPEP, Aminopeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPEPQ9H4A4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNPEPQ9H4A4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNPEPQ9H4A4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNPEPQ9H4A4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNPEPQ9H4A4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNPEPQ9H4A4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNPEPQ9H4A4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms