Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHID1Q9BWS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHID1Q9BWS9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHID1Q9BWS9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHID1Q9BWS9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms