Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAIPQ9BWF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAIPQ9BWF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAIPQ9BWF2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAIPQ9BWF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAIPQ9BWF2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms