Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUP88Q99567 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP88Q99567 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP88Q99567 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP88Q99567 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP88Q99567 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms