Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KC1Q96S38 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KC1Q96S38 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KC1Q96S38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms