Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPZA3Q96KX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPZA3Q96KX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPZA3Q96KX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPZA3Q96KX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms