Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APH1AQ96BI3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APH1AQ96BI3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APH1AQ96BI3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1AQ96BI3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms