Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APH1AQ96BI3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
APH1AQ96BI3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APH1AQ96BI3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
APH1AQ96BI3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APH1AQ96BI3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APH1AQ96BI3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APH1AQ96BI3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
APH1AQ96BI3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APH1AQ96BI3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APH1AQ96BI3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APH1AQ96BI3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APH1AQ96BI3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APH1AQ96BI3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APH1AQ96BI3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APH1AQ96BI3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APH1AQ96BI3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APH1AQ96BI3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APH1AQ96BI3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APH1AQ96BI3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APH1AQ96BI3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APH1AQ96BI3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APH1AQ96BI3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APH1AQ96BI3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APH1AQ96BI3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APH1AQ96BI3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APH1AQ96BI3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APH1AQ96BI3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APH1AQ96BI3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APH1AQ96BI3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APH1AQ96BI3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APH1AQ96BI3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APH1AQ96BI3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APH1AQ96BI3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APH1AQ96BI3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APH1AQ96BI3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APH1AQ96BI3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APH1AQ96BI3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APH1AQ96BI3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APH1AQ96BI3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APH1AQ96BI3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APH1AQ96BI3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APH1AQ96BI3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APH1AQ96BI3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APH1AQ96BI3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APH1AQ96BI3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APH1AQ96BI3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APH1AQ96BI3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APH1AQ96BI3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APH1AQ96BI3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APH1AQ96BI3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APH1AQ96BI3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APH1AQ96BI3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APH1AQ96BI3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APH1AQ96BI3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APH1AQ96BI3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APH1AQ96BI3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APH1AQ96BI3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APH1AQ96BI3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APH1AQ96BI3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APH1AQ96BI3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APH1AQ96BI3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APH1AQ96BI3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APH1AQ96BI3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APH1AQ96BI3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APH1AQ96BI3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APH1AQ96BI3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APH1AQ96BI3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APH1AQ96BI3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APH1AQ96BI3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APH1AQ96BI3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APH1AQ96BI3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APH1AQ96BI3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APH1AQ96BI3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APH1AQ96BI3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APH1AQ96BI3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APH1AQ96BI3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APH1AQ96BI3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APH1AQ96BI3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APH1AQ96BI3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APH1AQ96BI3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APH1AQ96BI3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APH1AQ96BI3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APH1AQ96BI3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APH1AQ96BI3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APH1AQ96BI3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APH1AQ96BI3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APH1AQ96BI3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APH1AQ96BI3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APH1AQ96BI3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms