Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPATA4Q8NEY3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPATA4Q8NEY3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPATA4Q8NEY3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPATA4Q8NEY3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPATA4Q8NEY3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms