Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRCH2Q5VUJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRCH2Q5VUJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRCH2Q5VUJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRCH2Q5VUJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms