Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF17Q5VTA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF17Q5VTA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF17Q5VTA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms