Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GEN1Q17RS7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GEN1Q17RS7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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