Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
EEA1Q15075 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
EEA1Q15075 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
EEA1Q15075 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
EEA1Q15075 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
EEA1Q15075 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
EEA1Q15075 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
EEA1Q15075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
EEA1Q15075 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms