Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN15P56746 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN15P56746 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN15P56746 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN15P56746 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN15P56746 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms