Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
YARSP54577 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YARSP54577 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YARSP54577 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
YARSP54577 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YARSP54577 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YARSP54577 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
YARSP54577 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
YARSP54577 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YARSP54577 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
YARSP54577 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YARSP54577 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YARSP54577 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
YARSP54577 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YARSP54577 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
YARSP54577 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
YARSP54577 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
YARSP54577 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
YARSP54577 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YARSP54577 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YARSP54577 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YARSP54577 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
YARSP54577 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YARSP54577 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
YARSP54577 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
YARSP54577 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YARSP54577 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YARSP54577 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YARSP54577 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YARSP54577 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YARSP54577 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YARSP54577 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YARSP54577 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YARSP54577 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YARSP54577 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YARSP54577 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YARSP54577 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YARSP54577 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
YARSP54577 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YARSP54577 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YARSP54577 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YARSP54577 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
YARSP54577 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
YARSP54577 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YARSP54577 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YARSP54577 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
YARSP54577 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YARSP54577 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YARSP54577 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YARSP54577 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YARSP54577 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YARSP54577 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YARSP54577 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YARSP54577 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YARSP54577 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YARSP54577 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YARSP54577 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YARSP54577 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YARSP54577 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YARSP54577 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YARSP54577 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YARSP54577 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YARSP54577 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YARSP54577 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YARSP54577 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YARSP54577 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YARSP54577 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms