Protein–RNA interactions for Protein: P52945

PDX1, Pancreas/duodenum homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDX1P52945 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDX1P52945 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDX1P52945 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDX1P52945 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDX1P52945 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDX1P52945 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDX1P52945 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDX1P52945 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDX1P52945 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDX1P52945 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDX1P52945 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDX1P52945 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDX1P52945 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDX1P52945 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDX1P52945 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDX1P52945 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDX1P52945 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDX1P52945 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDX1P52945 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDX1P52945 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDX1P52945 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDX1P52945 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDX1P52945 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDX1P52945 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDX1P52945 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDX1P52945 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDX1P52945 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDX1P52945 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDX1P52945 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDX1P52945 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDX1P52945 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDX1P52945 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDX1P52945 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDX1P52945 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDX1P52945 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDX1P52945 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDX1P52945 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDX1P52945 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDX1P52945 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDX1P52945 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDX1P52945 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDX1P52945 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDX1P52945 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDX1P52945 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDX1P52945 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDX1P52945 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDX1P52945 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDX1P52945 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDX1P52945 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDX1P52945 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDX1P52945 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDX1P52945 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDX1P52945 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDX1P52945 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDX1P52945 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDX1P52945 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDX1P52945 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDX1P52945 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDX1P52945 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDX1P52945 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDX1P52945 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDX1P52945 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDX1P52945 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDX1P52945 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDX1P52945 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDX1P52945 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms