Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBP50607 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBP50607 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBP50607 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBP50607 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBP50607 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBP50607 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBP50607 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBP50607 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBP50607 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBP50607 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBP50607 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBP50607 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBP50607 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBP50607 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBP50607 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBP50607 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBP50607 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBP50607 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBP50607 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBP50607 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBP50607 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBP50607 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBP50607 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBP50607 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBP50607 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBP50607 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBP50607 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBP50607 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBP50607 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBP50607 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBP50607 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBP50607 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBP50607 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBP50607 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBP50607 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBP50607 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBP50607 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBP50607 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBP50607 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBP50607 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBP50607 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBP50607 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBP50607 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBP50607 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBP50607 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBP50607 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBP50607 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBP50607 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBP50607 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBP50607 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBP50607 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBP50607 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBP50607 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBP50607 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBP50607 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBP50607 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBP50607 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBP50607 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBP50607 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBP50607 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBP50607 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBP50607 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBP50607 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBP50607 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBP50607 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBP50607 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBP50607 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms