Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RANGAP1P46060 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RANGAP1P46060 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RANGAP1P46060 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RANGAP1P46060 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RANGAP1P46060 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RANGAP1P46060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RANGAP1P46060 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RANGAP1P46060 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms