Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABRR2P28476 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRR2P28476 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABRR2P28476 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GABRR2P28476 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GABRR2P28476 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRR2P28476 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms