Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAX3P23760 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAX3P23760 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAX3P23760 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAX3P23760 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAX3P23760 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAX3P23760 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAX3P23760 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAX3P23760 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAX3P23760 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAX3P23760 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAX3P23760 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAX3P23760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX3P23760 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX3P23760 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX3P23760 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX3P23760 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAX3P23760 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX3P23760 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX3P23760 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX3P23760 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX3P23760 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAX3P23760 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX3P23760 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX3P23760 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX3P23760 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX3P23760 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAX3P23760 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAX3P23760 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAX3P23760 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAX3P23760 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAX3P23760 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAX3P23760 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAX3P23760 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAX3P23760 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAX3P23760 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAX3P23760 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PAX3P23760 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAX3P23760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAX3P23760 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAX3P23760 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAX3P23760 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAX3P23760 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAX3P23760 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAX3P23760 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAX3P23760 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAX3P23760 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAX3P23760 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PAX3P23760 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAX3P23760 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAX3P23760 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAX3P23760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAX3P23760 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAX3P23760 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAX3P23760 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAX3P23760 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAX3P23760 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAX3P23760 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAX3P23760 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAX3P23760 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PAX3P23760 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAX3P23760 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAX3P23760 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAX3P23760 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAX3P23760 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAX3P23760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAX3P23760 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAX3P23760 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAX3P23760 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAX3P23760 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PAX3P23760 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms