Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COX4I1P13073 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COX4I1P13073 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX4I1P13073 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I1P13073 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms