Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SUPT20HL2P0C7V6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUPT20HL2P0C7V6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUPT20HL2P0C7V6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUPT20HL2P0C7V6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUPT20HL2P0C7V6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms