Protein–RNA interactions for Protein: P00441

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1P00441 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOD1P00441 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOD1P00441 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOD1P00441 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOD1P00441 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOD1P00441 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOD1P00441 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOD1P00441 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOD1P00441 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOD1P00441 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOD1P00441 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOD1P00441 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOD1P00441 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOD1P00441 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOD1P00441 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOD1P00441 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOD1P00441 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOD1P00441 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOD1P00441 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOD1P00441 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOD1P00441 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOD1P00441 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOD1P00441 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOD1P00441 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOD1P00441 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOD1P00441 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOD1P00441 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOD1P00441 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOD1P00441 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOD1P00441 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOD1P00441 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOD1P00441 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOD1P00441 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOD1P00441 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOD1P00441 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOD1P00441 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOD1P00441 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOD1P00441 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOD1P00441 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOD1P00441 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOD1P00441 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOD1P00441 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOD1P00441 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOD1P00441 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOD1P00441 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms